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NumPy 之: 结构化数组详解

发布于: 2021 年 05 月 06 日

简介

普通的数组就是数组中存放了同一类型的对象。而结构化数组是指数组中存放不同对象的格式。

今天我们来详细探讨一下 NumPy 中的结构化数组。

结构化数组中的字段 field

因为结构化数组中包含了不同类型的对象,所以每一个对象类型都被称为一个 field。

每个 field 都有 3 部分,分别是:string 类型的 name,任何有效 dtype 类型的 type,还有一个可选的 title

看一个使用 filed 构建 dtype 的例子:

In [165]: np.dtype([('name', 'U10'), ('age', 'i4'), ('weight', 'f4')])Out[165]: dtype([('name', '<U10'), ('age', '<i4'), ('weight', '<f4')])
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我们可以使用上面的 dtype 类型来构建一个新的数组:

In [166]: x = np.array([('Rex', 9, 81.0), ('Fido', 3, 27.0)],     ...:     dtype=[('name', 'U10'), ('age', 'i4'), ('weight', 'f4')])     ...:
In [167]: xOut[167]:array([('Rex', 9, 81.), ('Fido', 3, 27.)], dtype=[('name', '<U10'), ('age', '<i4'), ('weight', '<f4')])
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x 是一个 1 维数组,每个元素都包含三个字段,name,age 和 weight。并且分别指定了他们的数据类型。

可以通过 index 来访问一行数据:

In [168]: x[1]Out[168]: ('Fido', 3, 27.)
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也可以通过 name 来访问一列数据 :

In [170]: x['name']Out[170]: array(['Rex', 'Fido'], dtype='<U10')
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还可以给所有的列统一赋值:

In [171]: x['age']Out[171]: array([9, 3], dtype=int32)
In [172]: x['age'] = 10
In [173]: xOut[173]:array([('Rex', 10, 81.), ('Fido', 10, 27.)], dtype=[('name', '<U10'), ('age', '<i4'), ('weight', '<f4')])
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结构化数据类型

上面的例子让我们对结构化数据类型有了一个基本的认识。结构化数据类型就是一系列的 filed 的集合。

创建结构化数据类型

结构化数据类型是从基础类型创建的,主要有下面几种方式:

从元组创建

每个元组都是(fieldname, datatype, shape)这样的格式,其中 shape 是可选的。fieldname 是 field 的 title。

In [174]: np.dtype([('x', 'f4'), ('y', np.float32), ('z', 'f4', (2, 2))])Out[174]: dtype([('x', '<f4'), ('y', '<f4'), ('z', '<f4', (2, 2))])
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如果 fieldname 是空字符的话,会以 f 开头的形式默认创建。

In [177]: np.dtype([('x', 'f4'), ('', 'i4'), ('z', 'i8')])Out[177]: dtype([('x', '<f4'), ('f1', '<i4'), ('z', '<i8')])
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从逗号分割的 dtype 创建

可以选择从逗号分割的 dtype 类型创建:

In [178]: np.dtype('i8, f4, S3')Out[178]: dtype([('f0', '<i8'), ('f1', '<f4'), ('f2', 'S3')])
In [179]: np.dtype('3int8, float32, (2, 3)float64')Out[179]: dtype([('f0', 'i1', (3,)), ('f1', '<f4'), ('f2', '<f8', (2, 3))])
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从字典创建

从字典创建是这样的格式: {‘names’: …, ‘formats’: …, ‘offsets’: …, ‘titles’: …, ‘itemsize’: …}

这种写法可以指定 name 列表和 formats 列表。

offsets 指的是每个字段的 byte offsets。titles 是字段的 title,itemsize 是整个 dtype 的 size。

In [180]: np.dtype({'names': ['col1', 'col2'], 'formats': ['i4', 'f4']})Out[180]: dtype([('col1', '<i4'), ('col2', '<f4')])
In [181]: np.dtype({'names': ['col1', 'col2'], ...: ... 'formats': ['i4', 'f4'], ...: ... 'offsets': [0, 4], ...: ... 'itemsize': 12}) ...:Out[181]: dtype({'names':['col1','col2'], 'formats':['<i4','<f4'], 'offsets':[0,4], 'itemsize':12})
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操作结构化数据类型

可以通过 dtype 的 names 和 fields 字段来访问结构化数据类型的属性:

>>> d = np.dtype([('x', 'i8'), ('y', 'f4')])>>> d.names('x', 'y')
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>>> d.fieldsmappingproxy({'x': (dtype('int64'), 0), 'y': (dtype('float32'), 8)})
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Offsets 和 Alignment

对于结构化类型来说,因为一个 dtype 中包含了多种数据类型,默认情况下这些数据类型是不对齐的。

我们可以通过下面的例子来看一下各个类型的偏移量:

>>> def print_offsets(d):...     print("offsets:", [d.fields[name][1] for name in d.names])...     print("itemsize:", d.itemsize)>>> print_offsets(np.dtype('u1, u1, i4, u1, i8, u2'))offsets: [0, 1, 2, 6, 7, 15]itemsize: 17
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如果在创建 dtype 类型的时候,指定了 align=True,那么这些类型之间可能会按照 C-struct 的结构进行对齐。

对齐的好处就是可以提升处理效率。我们看一个对齐的例子:

>>> print_offsets(np.dtype('u1, u1, i4, u1, i8, u2', align=True))offsets: [0, 1, 4, 8, 16, 24]itemsize: 32
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Field Titles

每个 Filed 除了 name 之外,还可以包含 title。

有两种方式来指定 title,第一种方式:

In [182]: np.dtype([(('my title', 'name'), 'f4')])Out[182]: dtype([(('my title', 'name'), '<f4')])
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第二种方式:

In [183]: np.dtype({'name': ('i4', 0, 'my title')})Out[183]: dtype([(('my title', 'name'), '<i4')])
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看一下 fields 的结构:

In [187]: d.fieldsOut[187]:mappingproxy({'my title': (dtype('float32'), 0, 'my title'),              'name': (dtype('float32'), 0, 'my title')})
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结构化数组

从结构化数据类型创建结构化数组之后,我们就可以对结构化数组进行操作了。

赋值

我们可以从元组中对结构化数组进行赋值:

>>> x = np.array([(1, 2, 3), (4, 5, 6)], dtype='i8, f4, f8')>>> x[1] = (7, 8, 9)>>> xarray([(1, 2., 3.), (7, 8., 9.)],     dtype=[('f0', '<i8'), ('f1', '<f4'), ('f2', '<f8')])
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还可以从标量对结构化数组进行赋值:

>>> x = np.zeros(2, dtype='i8, f4, ?, S1')>>> x[:] = 3>>> xarray([(3, 3., True, b'3'), (3, 3., True, b'3')],      dtype=[('f0', '<i8'), ('f1', '<f4'), ('f2', '?'), ('f3', 'S1')])>>> x[:] = np.arange(2)>>> xarray([(0, 0., False, b'0'), (1, 1., True, b'1')],      dtype=[('f0', '<i8'), ('f1', '<f4'), ('f2', '?'), ('f3', 'S1')])
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结构化数组还可以赋值给非机构化数组,但是前提是结构化数组只有一个 filed:

>>> twofield = np.zeros(2, dtype=[('A', 'i4'), ('B', 'i4')])>>> onefield = np.zeros(2, dtype=[('A', 'i4')])>>> nostruct = np.zeros(2, dtype='i4')>>> nostruct[:] = twofieldTraceback (most recent call last):...TypeError: Cannot cast array data from dtype([('A', '<i4'), ('B', '<i4')]) to dtype('int32') according to the rule 'unsafe'
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结构化数组还可以互相赋值:

>>> a = np.zeros(3, dtype=[('a', 'i8'), ('b', 'f4'), ('c', 'S3')])>>> b = np.ones(3, dtype=[('x', 'f4'), ('y', 'S3'), ('z', 'O')])>>> b[:] = a>>> barray([(0., b'0.0', b''), (0., b'0.0', b''), (0., b'0.0', b'')],      dtype=[('x', '<f4'), ('y', 'S3'), ('z', 'O')])
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访问结构化数组

之前讲到了,可以通过 filed 的名字来访问和修改一列数据:

>>> x = np.array([(1, 2), (3, 4)], dtype=[('foo', 'i8'), ('bar', 'f4')])>>> x['foo']array([1, 3])>>> x['foo'] = 10>>> xarray([(10, 2.), (10, 4.)],      dtype=[('foo', '<i8'), ('bar', '<f4')])
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返回的数值是原始数组的一个视图,他们是共享内存空间的,所以修改视图同时也会修改原数据。

看一个 filed 是多维数组的情况:

In [188]: np.zeros((2, 2), dtype=[('a', np.int32), ('b', np.float64, (3, 3))])Out[188]:array([[(0, [[0., 0., 0.], [0., 0., 0.], [0., 0., 0.]]),        (0, [[0., 0., 0.], [0., 0., 0.], [0., 0., 0.]])],       [(0, [[0., 0., 0.], [0., 0., 0.], [0., 0., 0.]]),        (0, [[0., 0., 0.], [0., 0., 0.], [0., 0., 0.]])]],      dtype=[('a', '<i4'), ('b', '<f8', (3, 3))])
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上面构建了一个 2 * 2 的矩阵,这个矩阵中的第一列是 int 类型,第二列是一个 3 * 3 的 float 矩阵。

我们可以这样来查看各个列的 shape 值:

>>> x = np.zeros((2, 2), dtype=[('a', np.int32), ('b', np.float64, (3, 3))])>>> x['a'].shape(2, 2)>>> x['b'].shape(2, 2, 3, 3)
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除了单列的访问之外,我们还可以一次访问多列数据:

>>> a = np.zeros(3, dtype=[('a', 'i4'), ('b', 'i4'), ('c', 'f4')])>>> a[['a', 'c']]array([(0, 0.), (0, 0.), (0, 0.)],     dtype={'names':['a','c'], 'formats':['<i4','<f4'], 'offsets':[0,8], 'itemsize':12})
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多列同时赋值:

>>> a[['a', 'c']] = (2, 3)>>> aarray([(2, 0, 3.), (2, 0, 3.), (2, 0, 3.)],      dtype=[('a', '<i4'), ('b', '<i4'), ('c', '<f4')])
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简单的交换列的数据:

>>> a[['a', 'c']] = a[['c', 'a']]
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Record Arrays

结构化数组只能通过 index 来访问,很不方便,为此 NumPy 提供了一个多维数组的子类 numpy.recarray, 然后可以通过属性来访问。

我们来看几个例子:

>>> recordarr = np.rec.array([(1, 2., 'Hello'), (2, 3., "World")],...                    dtype=[('foo', 'i4'),('bar', 'f4'), ('baz', 'S10')])>>> recordarr.bararray([ 2.,  3.], dtype=float32)>>> recordarr[1:2]rec.array([(2, 3., b'World')],      dtype=[('foo', '<i4'), ('bar', '<f4'), ('baz', 'S10')])>>> recordarr[1:2].fooarray([2], dtype=int32)>>> recordarr.foo[1:2]array([2], dtype=int32)>>> recordarr[1].bazb'World'
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recarray 返回的结果是一个 rec.array。除了使用 np.rec.array 来创建之外,还可以使用 view:

In [190]: arr = np.array([(1, 2., 'Hello'), (2, 3., "World")],     ...: ...                dtype=[('foo', 'i4'),('bar', 'f4'), ('baz', 'a10')])     ...:
In [191]: arrOut[191]:array([(1, 2., b'Hello'), (2, 3., b'World')], dtype=[('foo', '<i4'), ('bar', '<f4'), ('baz', 'S10')])
In [192]: arr.view(dtype=np.dtype((np.record, arr.dtype)), ...: ... type=np.recarray) ...:Out[192]:rec.array([(1, 2., b'Hello'), (2, 3., b'World')], dtype=[('foo', '<i4'), ('bar', '<f4'), ('baz', 'S10')])
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如果是 rec.array 对象,它的 dtype 类型会被自动转换成为 np.record 类型:

In [200]: recordarr.dtypeOut[200]: dtype((numpy.record, [('foo', '<i4'), ('bar', '<f4'), ('baz', 'S10')]))
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想要转换回原始的 np.ndarray 类型可以这样:

In [202]: recordarr.view(recordarr.dtype.fields or recordarr.dtype, np.ndarray)Out[202]:array([(1, 2., b'Hello'), (2, 3., b'World')],      dtype=[('foo', '<i4'), ('bar', '<f4'), ('baz', 'S10')])
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如果通过 index 或者 field 来访问 rec.array 对象的字段,如果字段是结构类型,那么会返回 numpy.recarray,如果是非结构类型,则会返回 numpy.ndarray:

>>> recordarr = np.rec.array([('Hello', (1, 2)), ("World", (3, 4))],...                 dtype=[('foo', 'S6'),('bar', [('A', int), ('B', int)])])>>> type(recordarr.foo)<class 'numpy.ndarray'>>>> type(recordarr.bar)<class 'numpy.recarray'>
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