问题描述
当 k8s 集群运行日久以后,有的 node 无法再新建 pod,并且出现如下错误,当重启服务器之后,才可以恢复正常使用。查看 pod 状态的时候会出现以下报错。
applying cgroup … caused: mkdir …no space left on device
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或者在 describe pod 的时候出现 cannot allocate memory。
这时候你的 k8s 集群可能就存在内存泄露的问题了,当创建的 pod 越多的时候内存会泄露的越多,越快。
具体查看是否存在内存泄露
$ cat /sys/fs/cgroup/memory/kubepods/memory.kmem.slabinfo
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当出现 cat: /sys/fs/cgroup/memory/kubepods/memory.kmem.slabinfo: Input/output error 则说明不存在内存泄露的情况 如果存在内存泄露会出现
slabinfo - version: 2.1
# name <active_objs> <num_objs> <objsize> <objperslab> <pagesperslab> : tunables <limit> <batchcount> <sharedfactor> : slabdata <active_slabs> <num_slabs> <sharedavail>
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解决方案
解决方法思路:关闭 runc 和 kubelet 的 kmem,因为升级内核的方案改动较大,此处不采用。
kmem 导致内存泄露的原因:
内核对于每个 cgroup 子系统的的条目数是有限制的,限制的大小定义在 kernel/cgroup.c #L139,当正常在 cgroup 创建一个 group 的目录时,条目数就加 1。我们遇到的情况就是因为开启了 kmem accounting 功能,虽然 cgroup 的目录删除了,但是条目没有回收。这样后面就无法创建 65535 个 cgroup 了。也就是说,在当前内核版本下,开启了 kmem accounting 功能,会导致 memory cgroup 的条目泄漏无法回收。
2.1 编译 runc
$ wget https://dl.google.com/go/go1.12.9.linux-amd64.tar.gz
$ tar xf go1.12.9.linux-amd64.tar.gz -C /usr/local/
# 写入bashrc
$ vim ~/.bashrc
$ export GOPATH="/data/Documents"
$ export GOROOT="/usr/local/go"
$ export PATH="$GOROOT/bin:$GOPATH/bin:$PATH"
$ export GO111MODULE=off
# 验证
$ source ~/.bashrc
$ go env
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$ mkdir -p /data/Documents/src/github.com/opencontainers/
$ cd /data/Documents/src/github.com/opencontainers/
$ git clone https://github.com/opencontainers/runc
$ cd runc/
$ git checkout v1.0.0-rc9 # 切到v1.0.0-rc9 tag
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# 安装编译组件
$ sudo yum install libseccomp-devel
$ make BUILDTAGS='seccomp nokmem'
# 编译完成之后会在当前目录下看到一个runc的可执行文件,等kubelet编译完成之后会将其替换
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2.2 编译 kubelet
$ mkdir -p /root/k8s/
$ cd /root/k8s/
$ git clone https://github.com/kubernetes/kubernetes
$ cd kubernetes/
$ git checkout v1.15.3
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FROM centos:centos7.3.1611
ENV GOROOT /usr/local/go
ENV GOPATH /usr/local/gopath
ENV PATH /usr/local/go/bin:$PATH
RUN yum install rpm-build which where rsync gcc gcc-c++ automake autoconf libtool make -y \
&& curl -L https://studygolang.com/dl/golang/go1.12.9.linux-amd64.tar.gz | tar zxvf - -C /usr/local
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$ docker run -it --rm -v /root/k8s/kubernetes:/usr/local/gopath/src/k8s.io/kubernetes build-k8s:centos-7.3-go-1.12.9-k8s-1.15.3 bash
$ cd /usr/local/gopath/src/k8s.io/kubernetes
#编译
$ GO111MODULE=off KUBE_GIT_TREE_STATE=clean KUBE_GIT_VERSION=v1.15.3 make kubelet GOFLAGS="-tags=nokmem"
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替换原有的 runc 和 kubelet
$ mv /usr/bin/kubelet /home/kubelet
$ mv /usr/bin/docker-runc /home/docker-runc
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$ systemctl stop docker
$ systemctl stop kubelet
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$ cp kubelet /usr/bin/kubelet
$ cp kubelet /usr/local/bin/kubelet
$ cp runc /usr/bin/docker-runc
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$ cat /sys/fs/cgroup/memory/kubepods/burstable/memory.kmem.usage_in_bytes
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$ cat /sys/fs/cgroup/memory/kubepods/memory.kmem.slabinfo
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