实例讲解将 Graph Explorer 搬上 JupyterLab
本文分享自华为云社区《将 Graph Explorer 搬上 JupyterLab:使用 GES4Jupyter 连接 GES 并进行图探索》,作者: 蜉蝣与海 。
GES4Jupyter 是一款可以在 JupyterLab 中连接访问 GES 并可视化的工具。工具中封装了部分 GES 业务面接口,并提供对返回数据的可视化能力。基于该工具在 Jupyter 上进行图探索,可以大大降低编码成本,丰富 JupyterLab 的数据表现力。
一、使用前准备
1. 华为云账号
在使用华为云服务之前您需要注册华为云帐号。通过此帐号,只需为使用的服务付费,即可使用所有华为云服务。
注册华为云账号步骤请点击:《华为云注册介绍》
注册成功后即可自动登录华为云,您需要完成 “实名认证” 才可以正常使用服务。
2. OBS 对象存储服务
OBS 即对象存储服务(Object Storage Service),GES 将 OBS 作为数据源导入数据。
数据若想导入图引擎服务 GES,需要先上传至 OBS。详情参考:华为云图引擎服务 GES 实战——创图
3. GES 图引擎服务
使用 GES4Jupyter 前,需要在图引擎服务控制台创建一个 GES 图实例,并且导入数据。本例中使用的数据源是新冠患者轨迹追溯数据集 v2,可以从 AI Gallery 中下载。详情参考:华为图引擎文档 - 快速入门和华为云图引擎服务 GES 实战 —— 创图
4. 获取调用 GES 业务面 API 必备的参数
调用 GES API 需要输入 token 鉴权信息,认证鉴权能力依赖华为云统一身份认证服务 IAM。获取 Token 需要用户名密码、图所在区域等信息。详情查看:华为图引擎文档 - 业务面 API 认证鉴权和调用 GES 服务业务面 API 相关参数的获取
二、使用 GES4Jupyter 连接 GES 服务
从华为云首页进入 ModelArts 控制台,点击 CodeLab 新建一个 Jupyter Notebook,并等待资源初始化完成。
新建一个 Notebook,使用下列代码获取 GES4Jupyter 程序和资源文件。
在 Notebook 中输入代码后,将该段文本配置为代码,然后点击左侧的运行按钮,并等待运行完成。
点击左上角的 “+” 号新建代码片段,输入下列代码段并运行,完成 GES4Jupyter 的初始化。
上面代码中涉及的字段含义基本分为两大类,简单介绍下:
用于构造 API 的参数:eip,projectId,graph_name, port 这四个参数都参与构造了业务面请求的 url。eip 与 graph_name 两个参数在创图时容易获得,port 参数默认为 80,开启安全模式时为 443,关于 projectId,可参考图引擎官网文档 - 获取项目 id,从图控制台根据图所属的区域来获取项目 id。
用于在请求 API 前获取 token 的参数:iam_url, user_name, password, domain_name,project_name,GES4Jupyter 会使用这四个参数获取 token,进而在使用 api 时进行鉴权,相关参数获取请参考:华为图引擎文档 - 业务面 API 认证鉴权和调用 GES 服务业务面 API 相关参数的获取
除了手动输入这部分参数,也可以将参数构造为一个 csv 文件上传至 CodeLab 平台,而后执行图示 read_csv_config 方法,一键获取所有参数。
如图为一个区域为北京四的图的示例文件,关键信息(如 ip、projectId、图名、账户名、密码、iam 子账号名)通过马赛克隐藏。
对于新创的图,使用下列代码段可以创建点边索引,方便使用 cypher:
如果图比较大,且没有基于 label 过滤方面的诉求,也可以关闭 cypher 的索引开关。
执行 summary 方法可以看到点边分布:
三、使用 GES4Jupyter 调用业务面接口并进行可视化
GES4Jupyter 支持调用 cypher 语句,并可视化 cypher 的结果。在初始化完成 GES4Jupyter 后,使用下列代码可以执行并可视化 cypher 查询:
在 Notebook 中输入该段代码,点击运行,可以看到 Notebook 中效果:
同时,工具还提供了其他选项卡,不仅可以看到可视化 Graph 结构,还可以看到表格数据、以及原始的 json 数据。
GES4Jupyter 也提供了能力对 gremlin 语言返回的点边数据进行可视化。
同时,对于 ges 的 path-query 接口,当返回数据为 tree 格式时,GES4Jupyter 也能提供较好的支持。
四、图引擎官网有更多案例可以使用 GES4Jupyter 上手体验
本文的数据集取自华为云图引擎官网 “新冠患者轨迹追溯” 数据集,notebook 代码取自 “新冠患者轨迹追溯” 案例,在图引擎官方网站上,还有其他动手实践案例,配套 ModelArts 的 CodeLab,可以实现 “开箱即用”,提供丰富的场景和大家一起认识图、了解图、使用图。
参考项目:https://github.com/merqurio/neo4jupyter
版权声明: 本文为 InfoQ 作者【华为云开发者联盟】的原创文章。
原文链接:【http://xie.infoq.cn/article/bd06151af1668508a05ff9320】。文章转载请联系作者。
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