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OceanBase 存储层代码解读(四):宏块的垃圾回收和坏块检查

  • 2022 年 9 月 25 日
    浙江
  • 本文字数:4194 字

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在上一篇文章,我们通过走读OceanBase宏块的代码,对其存储格式有了初步的了解,我们知道微块作为读 I/O 最小单元,宏块是写 I/O 的最小单元。那我要考考你了,OceanBase 的垃圾回收(GC)和坏块检查是以微块还是宏块作为单位呢?答案很明显,就是宏块。因为既然是以宏块为单位写,所以肯定是以宏块为单位进行清理和检查的。和本专题前几篇文章类似,本文主要通过走读相关代码,了解宏块垃圾回收和坏块检查的原理。


注:本文所有的说明及代码都是基于v3.1.0_CE_BP1版本的 OceanBase 开源代码。

任务调度

OceanBase 线程管理是封装好的,支持如下多种不同模式的线程管理:


// deps/oblib/src/lib/thread/thread_mgr.henum class TGType {  INVALID,  THREAD_POOL,    // 线程池  OB_THREAD_POOL,  // OB线程池  TIMER,      // 定时任务  TIMER_GROUP,    // 定时任务组  QUEUE_THREAD,    // 队列线程调度  DEDUP_QUEUE,    // 去重队列调度  ASYNC_TASK_QUEUE,  // 异步任务队列调度};
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OceanBase 宏块的垃圾回收和坏块检查主要采用 TIMER 定时任务调度,TIMER 的主要特点是启动一个后台线程,周期性的对任务进行调度。关于其他的调度方式,后续会单独介绍。


既然采用 TIMER 调度,那么其调度的时机也很明显,在启动 OBServer 进程时,就启动了一个后台线程,周期性的进行垃圾回收和坏块检查,代码如下(省略了部分和垃圾回收无关的代码)。


// src/storage/blocksstable/ob_store_file.cppint ObStoreFile::open(const bool is_physical_flashback){  int ret = OB_SUCCESS;  bool is_replay_old = false;
// 打开StoreFile,并做相关初始化的动作 ... // 执行首次GC enable_mark_sweep(); mark_and_sweep(); // 启动GC定时任务线程 // 调度GC的任务 // 调度坏块检查的任务 if (OB_FAIL(TG_START(lib::TGDefIDs::StoreFileGC))) { STORAGE_LOG(WARN, "The timer has not been inited, ", K(ret)); } else if (OB_FAIL(TG_SCHEDULE(lib::TGDefIDs::StoreFileGC, gc_task_, RECYCLE_DELAY_US, true))) { STORAGE_LOG(WARN, "Fail to schedule gc task, ", K(ret)); } else if (OB_FAIL(TG_SCHEDULE(lib::TGDefIDs::StoreFileGC, inspect_bad_block_task_, INSPECT_DELAY_US, true))) { STORAGE_LOG(WARN, "Fail to schedule bad_block_inspect task, ", K(ret)); } else { // ...}
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垃圾回收和坏块检查线程的生命周期和 OBServer 进程是一致的,它们都会在 ObStoreFile::destroy 中停止。

宏块的垃圾回收

宏块垃圾回收的任务定义如下:


// src/storage/blocksstable/ob_store_file.h// ObTimerTask为定时任务的基类class ObStoreFileGCTask : public common::ObTimerTask {public:  ObStoreFileGCTask();  virtual ~ObStoreFileGCTask();  // 继承至ObTimerTask,GC的主要执行函数在:ObStoreFile::mark_and_sweep()  virtual void runTimerTask()   {    OB_STORE_FILE.mark_and_sweep();  }};
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ObStoreFile::mark_and_sweep 主要逻辑是对所有在用的宏块进行打标,并检查未打标的宏块,将其中 ref_cnt_为 0 的进行垃圾回收。


// src/storage/blocksstable/ob_store_file.cpp
void ObStoreFile::mark_and_sweep(){ int ret = OB_SUCCESS; MacroBlockId macro_id; bool is_freed = false;
// 检查GC任务的开关 if (!is_mark_sweep_enabled()) { STORAGE_LOG(INFO, "mark and sweep is disabled, do not mark and sweep this round"); } else { // 标识开始进行gc set_mark_sweep_doing();
// 1. 采用bitmap对所有在使用的宏块进行打标 // a. data块的打标是通过一个宏块迭代器实现的 // b. meta块的打标比较简单,因为可用的meta块是记录在一个数组中的 // 经过打标之后我们就得到所有有效的宏块的bitmap if (OB_FAIL(mark_macro_blocks())) { STORAGE_LOG(WARN, "Fail to mark macro blocks, ", K(ret)); }
// 2. 遍历所有的宏块,进行垃圾清理 begin_time = end_time; if (OB_SUCC(ret)) { for (int64_t i = 0; i < store_file_system_->get_total_macro_block_count() && is_mark_sweep_enabled(); ++i) { if (bitmap_test(i)) { // 有效的宏块,做个二次检查 if (macro_block_info_[i].is_free_) { // BUG, should not happen STORAGE_LOG(ERROR, "the macro block is freed, ", K(i)); } } else { // 无用的宏块,进行GC if (0 == ATOMIC_LOAD(&(macro_block_info_[i].ref_cnt_))) { // ref为0,即可进行清理 if (!macro_block_info_[i].is_free_) { // 释放宏块 // a. 将该宏块信息进行标注:is_free_=true // b. 将该宏块id放入到free_block_array_中,后续进行二次重用 free_block((uint32_t)i, is_freed); // ... } } } } } set_mark_sweep_done(); }}
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坏块检查

坏块检查任务也会在 StoreFileGC 线程做,该任务也是一个定时任务,它的定义如下:


class ObFileSystemInspectBadBlockTask : public common::ObTimerTask {public:  // 继承至ObTimerTask,主要执行函数在inspect_bad_block  virtual void runTimerTask()  {     inspect_bad_block();  }private:  // 遍历所有的宏块,通过check_macro_block进行宏块检查  // 由于坏块检查比较耗费资源,inspect_bad_block中也做一些流控逻辑  void inspect_bad_block();  // 对某1个宏块进行检查,检查的主要内容有:  //   a. 宏块id、宏块元数据  //   b. 通过check_data_block对宏块数据进行深度检查  int check_macro_block(const ObMacroBlockInfoPair& pair, const storage::ObTenantFileKey& file_key);  int check_data_block(const MacroBlockId& macro_id, const blocksstable::ObFullMacroBlockMeta& full_meta,      const storage::ObTenantFileKey& file_key);private:  // 工具类,宏块检查主要函数,后面会详细分析  ObSSTableMacroBlockChecker macro_checker_;};
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坏块检查的代价普遍较高,因为可能需要从磁盘读取所有宏块的内容,并进行 checksum 校验,会占用大量的 CPU、I/O 能力,进而影响业务流量。所以,OceanBase 的坏块检查支持不同级别的检查,DBA 可以根据系统自身的特点,比如磁盘、CPU 的具体配置等,选取合适的级别进行坏块检查,支持级别具体如下。


// src/storage/blocksstable/ob_macro_block_checker.henum ObMacroBlockCheckLevel {  CHECK_LEVEL_NOTHING = 0,// 不做坏块检查  CHECK_LEVEL_MACRO,      // 检查宏块的checksum,如果宏块的checksum不存在直接返回成功  CHECK_LEVEL_MICRO,      // 检查微块的checksum  CHECK_LEVEL_ROW,        // 检查每个column的checksum,会遍历每一行的每一列  CHECK_LEVEL_AUTO,       // 默认的检查级别,如果宏块的checksum存在,就检查宏块,如果宏块的checksum不存在,就检查微块  CHECK_LEVEL_MAX};
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接下来我们看下 ObSSTableMacroBlockChecker 的主要内容:


// src/storage/blocksstable/ob_macro_block_checker.h// note: 该class中的函数是线程不安全的class ObSSTableMacroBlockChecker {public:  // check是宏块检查主要函数,会根据check_level进行不同级别的检查  // 具体内容的检查见private中的函数  int check(const char* macro_block_buf, const int64_t macro_block_buf_size, const ObFullMacroBlockMeta& meta,      ObMacroBlockCheckLevel check_level = CHECK_LEVEL_AUTO);private:  // 检查宏块数据buffer的checksum,并和header中checksum中做比较  int check_macro_buf(      const ObMacroBlockCommonHeader& common_header, const char* macro_block_buf, const int64_t macro_block_buf_size);  // 检查宏块数据的header,具体的检查内容包括:  //   a. check_sstable_data_header:检查sstable数据的header  //   b. check_lob_data_header:检查log数据的header  //   c. check_bloomfilter_data_header:检查header中的bloomfilter  int check_data_header(const ObMacroBlockCommonHeader& common_header, const char* macro_block_buf,      const int64_t macro_block_buf_size, const ObFullMacroBlockMeta& meta);  // 检查普通宏块的具体数据,遍历宏块中每一个微块,微块的检查见下面的check_micro_data  int check_data_block(const char* macro_block_buf, const int64_t macro_block_buf_size,      const ObFullMacroBlockMeta& meta, const bool need_check_row);  // 检查LOB宏块的具体数据,包括其中所有的微块  int check_lob_block(      const char* macro_block_buf, const int64_t macro_block_buf_size, const ObFullMacroBlockMeta& meta);  // 检查微块的具体数据,包括其中每一行的每一列的checksum  int check_micro_data(      const char* micro_buf, const int64_t micro_buf_size, const ObFullMacroBlockMeta& meta, int64_t* checksum);  // 检查sstable宏块header  int check_sstable_data_header(      const ObMacroBlockCommonHeader& common_header, const char* macro_block_buf, const ObFullMacroBlockMeta& meta);  // 检查LOB宏块header  int check_lob_data_header(      const ObMacroBlockCommonHeader& common_header, const char* macro_block_buf, const ObFullMacroBlockMeta& meta);  // 检查bloomfilter中的header  int check_bloomfilter_data_header(      const ObMacroBlockCommonHeader& common_header, const char* macro_block_buf, const ObFullMacroBlockMeta& meta);};
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总结

相较于宏块、微块的编码来说,宏块的垃圾回收和坏块检查的代码大致逻辑简单易懂,但其中也不乏精巧的细节,比如,垃圾回收中的 bitmap 的使用和坏块检查中的流控,如果你有兴趣的话可以详细阅读上述代码。我们在下一篇文章会继续阅读 sstable 的合并、dag 的调度等代码,和你一起交流存储技术。

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