在上一篇文章,我们通过走读OceanBase宏块的代码,对其存储格式有了初步的了解,我们知道微块作为读 I/O 最小单元,宏块是写 I/O 的最小单元。那我要考考你了,OceanBase 的垃圾回收(GC)和坏块检查是以微块还是宏块作为单位呢?答案很明显,就是宏块。因为既然是以宏块为单位写,所以肯定是以宏块为单位进行清理和检查的。和本专题前几篇文章类似,本文主要通过走读相关代码,了解宏块垃圾回收和坏块检查的原理。
注:本文所有的说明及代码都是基于v3.1.0_CE_BP1版本的 OceanBase 开源代码。
任务调度
OceanBase 线程管理是封装好的,支持如下多种不同模式的线程管理:
// deps/oblib/src/lib/thread/thread_mgr.h
enum class TGType {
INVALID,
THREAD_POOL, // 线程池
OB_THREAD_POOL, // OB线程池
TIMER, // 定时任务
TIMER_GROUP, // 定时任务组
QUEUE_THREAD, // 队列线程调度
DEDUP_QUEUE, // 去重队列调度
ASYNC_TASK_QUEUE, // 异步任务队列调度
};
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OceanBase 宏块的垃圾回收和坏块检查主要采用 TIMER 定时任务调度,TIMER 的主要特点是启动一个后台线程,周期性的对任务进行调度。关于其他的调度方式,后续会单独介绍。
既然采用 TIMER 调度,那么其调度的时机也很明显,在启动 OBServer 进程时,就启动了一个后台线程,周期性的进行垃圾回收和坏块检查,代码如下(省略了部分和垃圾回收无关的代码)。
// src/storage/blocksstable/ob_store_file.cpp
int ObStoreFile::open(const bool is_physical_flashback)
{
int ret = OB_SUCCESS;
bool is_replay_old = false;
// 打开StoreFile,并做相关初始化的动作
...
// 执行首次GC
enable_mark_sweep();
mark_and_sweep();
// 启动GC定时任务线程
// 调度GC的任务
// 调度坏块检查的任务
if (OB_FAIL(TG_START(lib::TGDefIDs::StoreFileGC))) {
STORAGE_LOG(WARN, "The timer has not been inited, ", K(ret));
} else if (OB_FAIL(TG_SCHEDULE(lib::TGDefIDs::StoreFileGC, gc_task_, RECYCLE_DELAY_US, true))) {
STORAGE_LOG(WARN, "Fail to schedule gc task, ", K(ret));
} else if (OB_FAIL(TG_SCHEDULE(lib::TGDefIDs::StoreFileGC, inspect_bad_block_task_, INSPECT_DELAY_US, true))) {
STORAGE_LOG(WARN, "Fail to schedule bad_block_inspect task, ", K(ret));
} else {
// ...
}
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垃圾回收和坏块检查线程的生命周期和 OBServer 进程是一致的,它们都会在 ObStoreFile::destroy 中停止。
宏块的垃圾回收
宏块垃圾回收的任务定义如下:
// src/storage/blocksstable/ob_store_file.h
// ObTimerTask为定时任务的基类
class ObStoreFileGCTask : public common::ObTimerTask {
public:
ObStoreFileGCTask();
virtual ~ObStoreFileGCTask();
// 继承至ObTimerTask,GC的主要执行函数在:ObStoreFile::mark_and_sweep()
virtual void runTimerTask()
{
OB_STORE_FILE.mark_and_sweep();
}
};
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ObStoreFile::mark_and_sweep 主要逻辑是对所有在用的宏块进行打标,并检查未打标的宏块,将其中 ref_cnt_为 0 的进行垃圾回收。
// src/storage/blocksstable/ob_store_file.cpp
void ObStoreFile::mark_and_sweep()
{
int ret = OB_SUCCESS;
MacroBlockId macro_id;
bool is_freed = false;
// 检查GC任务的开关
if (!is_mark_sweep_enabled()) {
STORAGE_LOG(INFO, "mark and sweep is disabled, do not mark and sweep this round");
} else {
// 标识开始进行gc
set_mark_sweep_doing();
// 1. 采用bitmap对所有在使用的宏块进行打标
// a. data块的打标是通过一个宏块迭代器实现的
// b. meta块的打标比较简单,因为可用的meta块是记录在一个数组中的
// 经过打标之后我们就得到所有有效的宏块的bitmap
if (OB_FAIL(mark_macro_blocks())) {
STORAGE_LOG(WARN, "Fail to mark macro blocks, ", K(ret));
}
// 2. 遍历所有的宏块,进行垃圾清理
begin_time = end_time;
if (OB_SUCC(ret)) {
for (int64_t i = 0; i < store_file_system_->get_total_macro_block_count() && is_mark_sweep_enabled(); ++i) {
if (bitmap_test(i)) {
// 有效的宏块,做个二次检查
if (macro_block_info_[i].is_free_) {
// BUG, should not happen
STORAGE_LOG(ERROR, "the macro block is freed, ", K(i));
}
} else {
// 无用的宏块,进行GC
if (0 == ATOMIC_LOAD(&(macro_block_info_[i].ref_cnt_))) {
// ref为0,即可进行清理
if (!macro_block_info_[i].is_free_) {
// 释放宏块
// a. 将该宏块信息进行标注:is_free_=true
// b. 将该宏块id放入到free_block_array_中,后续进行二次重用
free_block((uint32_t)i, is_freed);
// ...
}
}
}
}
}
set_mark_sweep_done();
}
}
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坏块检查
坏块检查任务也会在 StoreFileGC 线程做,该任务也是一个定时任务,它的定义如下:
class ObFileSystemInspectBadBlockTask : public common::ObTimerTask {
public:
// 继承至ObTimerTask,主要执行函数在inspect_bad_block
virtual void runTimerTask()
{
inspect_bad_block();
}
private:
// 遍历所有的宏块,通过check_macro_block进行宏块检查
// 由于坏块检查比较耗费资源,inspect_bad_block中也做一些流控逻辑
void inspect_bad_block();
// 对某1个宏块进行检查,检查的主要内容有:
// a. 宏块id、宏块元数据
// b. 通过check_data_block对宏块数据进行深度检查
int check_macro_block(const ObMacroBlockInfoPair& pair, const storage::ObTenantFileKey& file_key);
int check_data_block(const MacroBlockId& macro_id, const blocksstable::ObFullMacroBlockMeta& full_meta,
const storage::ObTenantFileKey& file_key);
private:
// 工具类,宏块检查主要函数,后面会详细分析
ObSSTableMacroBlockChecker macro_checker_;
};
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坏块检查的代价普遍较高,因为可能需要从磁盘读取所有宏块的内容,并进行 checksum 校验,会占用大量的 CPU、I/O 能力,进而影响业务流量。所以,OceanBase 的坏块检查支持不同级别的检查,DBA 可以根据系统自身的特点,比如磁盘、CPU 的具体配置等,选取合适的级别进行坏块检查,支持级别具体如下。
// src/storage/blocksstable/ob_macro_block_checker.h
enum ObMacroBlockCheckLevel {
CHECK_LEVEL_NOTHING = 0,// 不做坏块检查
CHECK_LEVEL_MACRO, // 检查宏块的checksum,如果宏块的checksum不存在直接返回成功
CHECK_LEVEL_MICRO, // 检查微块的checksum
CHECK_LEVEL_ROW, // 检查每个column的checksum,会遍历每一行的每一列
CHECK_LEVEL_AUTO, // 默认的检查级别,如果宏块的checksum存在,就检查宏块,如果宏块的checksum不存在,就检查微块
CHECK_LEVEL_MAX
};
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接下来我们看下 ObSSTableMacroBlockChecker 的主要内容:
// src/storage/blocksstable/ob_macro_block_checker.h
// note: 该class中的函数是线程不安全的
class ObSSTableMacroBlockChecker {
public:
// check是宏块检查主要函数,会根据check_level进行不同级别的检查
// 具体内容的检查见private中的函数
int check(const char* macro_block_buf, const int64_t macro_block_buf_size, const ObFullMacroBlockMeta& meta,
ObMacroBlockCheckLevel check_level = CHECK_LEVEL_AUTO);
private:
// 检查宏块数据buffer的checksum,并和header中checksum中做比较
int check_macro_buf(
const ObMacroBlockCommonHeader& common_header, const char* macro_block_buf, const int64_t macro_block_buf_size);
// 检查宏块数据的header,具体的检查内容包括:
// a. check_sstable_data_header:检查sstable数据的header
// b. check_lob_data_header:检查log数据的header
// c. check_bloomfilter_data_header:检查header中的bloomfilter
int check_data_header(const ObMacroBlockCommonHeader& common_header, const char* macro_block_buf,
const int64_t macro_block_buf_size, const ObFullMacroBlockMeta& meta);
// 检查普通宏块的具体数据,遍历宏块中每一个微块,微块的检查见下面的check_micro_data
int check_data_block(const char* macro_block_buf, const int64_t macro_block_buf_size,
const ObFullMacroBlockMeta& meta, const bool need_check_row);
// 检查LOB宏块的具体数据,包括其中所有的微块
int check_lob_block(
const char* macro_block_buf, const int64_t macro_block_buf_size, const ObFullMacroBlockMeta& meta);
// 检查微块的具体数据,包括其中每一行的每一列的checksum
int check_micro_data(
const char* micro_buf, const int64_t micro_buf_size, const ObFullMacroBlockMeta& meta, int64_t* checksum);
// 检查sstable宏块header
int check_sstable_data_header(
const ObMacroBlockCommonHeader& common_header, const char* macro_block_buf, const ObFullMacroBlockMeta& meta);
// 检查LOB宏块header
int check_lob_data_header(
const ObMacroBlockCommonHeader& common_header, const char* macro_block_buf, const ObFullMacroBlockMeta& meta);
// 检查bloomfilter中的header
int check_bloomfilter_data_header(
const ObMacroBlockCommonHeader& common_header, const char* macro_block_buf, const ObFullMacroBlockMeta& meta);
};
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总结
相较于宏块、微块的编码来说,宏块的垃圾回收和坏块检查的代码大致逻辑简单易懂,但其中也不乏精巧的细节,比如,垃圾回收中的 bitmap 的使用和坏块检查中的流控,如果你有兴趣的话可以详细阅读上述代码。我们在下一篇文章会继续阅读 sstable 的合并、dag 的调度等代码,和你一起交流存储技术。
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