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分子育种

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Sentieon | 鸡全基因组(WGS)分析流程

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今天给大家介绍的是基于 Sentieon 软件开发的用于鸡全基因组测序数据的自动化流程脚本。鸡样本测序深度为55.26X,从FASTQ到VCF全流程分析最快用时29.21分钟,大幅缩短了鸡的全基因组WGS分析时间,有效加快畜禽的分子育种进程。

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Sentieon | 水稻全基因组(WGS)分析全流程

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10-29

36.98X的水稻样本从FASTQ到VCF全流程分析最快用时8分钟,大幅缩短了水稻全基因组WGS分析时间,有效加快水稻的分子育种进程。

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Sentieon | 猪全基因组(WGS)分析全流程

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10-11

今天给大家介绍的是基于 Sentieon 软件开发的用于猪全基因组测序数据的自动化流程脚本。该流程实现了从原始测序数据(FASTQ)到变异检测结果(GVCF)以及joint calling的完整分析流程,支持多个测序平台和输出格式。

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Sentieon 项目文章 | 泛基因组揭示小麦结构变异与栖息地及育种的关联

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09-04

普通小麦约3500-4000年前传入中国,逐渐成为华北主要农作物。 多样化的生态类型和复杂的饮食文化需求,共同驱动了中国小麦遗传多样性的形成与演变。 研究团队选取17个具有代表性的品种进行基因组测序,结合现有的泛基因组资源,识别出大量结构变异.

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