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Sentieon | 每周文献 -Gene Editing- 第二十八期

作者:INSVAST
  • 2024-02-24
    广东
  • 本文字数:1005 字

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  • 标题(英文):CRISPR-Cas9 generated Pompe knock-in murine model exhibits early-onset hypertrophic cardiomyopathy and skeletal muscle weakness

  • 标题(中文):CRISPR-Cas9 生成的庞贝敲入小鼠模型表现出早发性肥厚型心肌病和骨骼肌无力

  • 发表期刊:scientific reports

  • 作者单位:加州大学圣地亚哥分校等

  • 发表年份:2020

  • 文章地址:

  • https://doi.org/10.1038/s41598-020-65259-8



庞贝病,由酸α-葡萄糖苷酶(GAA;EC 3.2.1.20),其特征在于糖原在身体组织(主要是心脏和骨骼肌)中的溶酶体积累。肌肉溶酶体糖原贮积导致肌无力,发病年龄和严重程度根据残留的 GAA 酶活性而变化。婴儿发病的庞贝病 (IOPD) 由几乎缺失的 GAA 酶引起,通常在出生后前 2 个月内表现为进行性和重度肥厚型心肌病、心力衰竭、肌张力减退、呼吸衰竭和出生后 14 个月内死亡


婴儿发病的庞贝病 (IOPD) 由溶酶体酸 α-葡萄糖苷酶 (GAA) 突变引起,表现为快速进展的致死性心脏和骨骼肌病,通过合成 GAA 静脉输注不完全减弱。目前可用的小鼠模型不能完全模拟人类眼压,显示骨骼肌病伴迟发性肥厚型心肌病。


在这项研究中,研究者报告了利用新的双单向导 RNA 方法,成功地产生了 Gaac.1826dupA (p.Y609*)14 小鼠庞贝氏症基因敲入模型。


在该研究中,研究者使用 Sentieon 软件进行胚系变异检测。




综上所述,该研究结果强烈表明 Gaac.1826dupA 小鼠应用作首选的临床前庞贝病模型,用于评估基于基因组校正和其他基因组靶向治疗策略。

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Sentieon 为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案,其分析流程完全忠于 BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、picard 等金标准的数学模型。在匹配开源流程分析结果的前提下,大幅提升 WGS、WES、Panel、UMI、ctDNA、RNA 等测序数据的分析效率和检出精度,并匹配目前全部第二代、三代测序平台。



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