Sentieon | 每周文献 -Tumor Sequencing- 第二十五期

肿瘤测序系列文章-1

• 标题（英文） ：Thiabendazole Inhibits Glioblastoma Cell Proliferation and Invasion Targeting Mini-chromosome Maintenance Protein 2

• 标题（中文） ：噻苯咪唑靶向小染色体维护蛋白 2 抑制胶质母细胞瘤细胞增殖和侵袭

• 发表期刊：The Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics

• 作者单位：齐鲁医院等

• 发表年份：2021

• 文章地址：

• https://jpet.aspetjournals.org/content/380/1/63

图 1 文献介绍

美国食品药品监督管理局（FDA）批准噻苯达唑（TBZ）用于人口服，在体外和动物模型中对癌细胞具有潜在的抗癌活性。在该研究中，研究者评估了 TBZ 治疗人多形性胶质母细胞瘤 （GBM） 的疗效。TBZ 以剂量和时间依赖性方式降低了 GBM 细胞（P3、U251、LN229、A172 和 U118MG）相对于对照组的活力。然而，正常人星形胶质细胞 （NHA） 表现出更大的 IC50 比肿瘤细胞系，因此对其细胞毒性作用的抵抗力更强。在该研究中，研究者使用 Sentieon 软件进行变异检测。**

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图 2 Sentieon 的作用

图 3 噻苯咪唑（TBZ）可下调多形性胶质母细胞瘤体外细胞中的小染色体维护复合体成分 2（MCM2）mRNA 和蛋白质。

综上所述，TBZ 通过诱导 G2/M 期细胞周期停滞来抑制 GBM 的增殖，并抑制 GBM 肿瘤细胞的侵袭。基于对公开数据集的分析，TBZ 下调了 MCM2 的表达，MCM2 在 GBM 中过表达。敲除 MCM2 在体外减少 GBM 肿瘤的生长和侵袭，TBZ 在体内抑制 GBM 细胞的生长。因此，这些发现值得进一步研究将 TBZ 重新用于治疗 GBM 患者。然而，该研究动物模型中，TBZ 确实减缓了肿瘤的生长，但最终肿瘤会杀死荷瘤小鼠，这可能是由于 TBZ 耐药的肿瘤细胞。因此，TBZ 治疗下的这一恢复阶段也将是未来研究的兴趣所在。

肿瘤测序系列文章-2

• 标题（英文） ：Integrative Genomic Analysis of Drug Resistance in MET Exon 14 Skipping Lung Cancer Using Patient-Derived Xenograft Models

• 标题（中文） ：利用患者衍生异种移植模型 MET 14 号外显子跳跃肺癌耐药性进行基因组综合分析

• 发表期刊：Research Square

• 作者单位：上海交通大学附属胸科医院等

• 发表年份：2022

• 文章地址：

• https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-1212871/v1

图 1 文献介绍

由 MET 14 号外显子跳跃（MET ex14） 驱动的非小细胞肺癌 （NSCLC） 发生在 3-4% 的 NSCLC 病例中，并定义了具有独特特征的患者子集。MET 靶向治疗已引起强烈的临床反应，但对这些患者获得的药物耐药性知之甚少。患者来源的异种移植 （PDX） 模型被认为是优秀的临床前模型，有助于理解耐药性的潜在机制。该研究中，研究者对 352 例 SUDP 病例进行了表型分析和外显子组测序。研究者分析了 294 个“SUDP 基因”的变异，其机制可能与猝死有关。在具有亲本数据（trios）的 73 例病例中，进行了外显子组析，并进行了队列范围的突变负荷分析。在该研究中，研究者使用 Sentieon 软件进行数据比对、去重复、BQSR 及体细胞变异检测等。

图 2 Sentieon 的作用

图 3 患者肿瘤和相应 PDX 模型的基因和转录组特征描述模型

总之，该研究建立并表征了一对 MET ex14 NSCLC 患者来源的异种移植物 （PDX），包括第一个克唑替尼耐药的 MET ex14 PDX。该模型将成为测试耐药机制假设和研究新型治疗策略的有力工具。

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