用不了 AlphaFold2？北鲲云高性能计算平台解决这个问题

蛋白质生物细胞内的机器，要想知道“机器”的工作过程，就要先了解其结构和组成。比如说，如果想要知道某个蛋白在疾病当中有什么作用的话，就需要了解他的结构，再通过设计药物分子来抑制它的功能，降低机器的工作效率。在研究基因调控，蛋白结构和功能的时候，重组蛋白表达技术是关键的一环，但用什么实验可以破解蛋白质的结构，想要破解一个其中需要耗费的人力和物力都是巨大的，在全世界的努力下，才解析了 5 万个人类蛋白质结构，只占了人体蛋白质总数的 35%，其未来需要做的工作量依旧很巨大。

在历史上蛋白质预测已经走过很长的一段路了，每两年蛋白质结构预测比赛都已经举办有二十多年了，在这个过程中每个参赛组别之间的差距只有百分之几，慢得几乎看不出来变化，直到 2018 年的时候，第一名以领先第二名近 20%的成绩轰动世界，AlphaFold 正式登上蛋白质结构预测的舞台。

AlphaFold 主要是通过预测蛋白质主链和氨基酸之间的距离，分布，然后用预测的结果构建打分函数，再用片段组装的方法推导蛋白质结构。也就是这种方式点燃了整个行业的热情，用春雨惊雷般的气势，注入了勃勃生机。

如今，AlphaFold2 向社会免费提供所有的蛋白质预测结果，这是造福全世界的一项举动，各个国家的科研人员都可以节省预测时间，从而有更多的时间分析结构，进行药物设计。尽管如此，另外一个难题摆在众多科研人员的眼前，数据库有了，但怎么能够从里面快速，方便地找到自己需要的数据呢？

因为数据庞大 AlphaFold2 对于配置的要求非常高，3T 以上的硬盘，12 个虚拟的 CPU，至少 85GB 的内存，一个价值至少在 7 万元的 Nvidia A100，面对这些重重困难，研究人员应该如何使用 AlphaFold2 呢？

北鲲云超算平台协助解决这个问题，如今北鲲云超算平台已经成功上线 AlphaFold2，无需安装，在浏览器就可以直接使用，并且在启动工作站的同时，加载 AlphaFold2 模板，随之开始进行蛋白质结构预测。

北鲲云高性能计算平台还部署 Nvidia A100 和 Nvidia V100 GPU，保障蛋白质预测工作的高速完成。而平台贴心的 7*24 小时服务更是让使用无忧，无论在什么时候使用发现问题，都可以寻求帮助，让科研顺利进行。