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在 Kubernetes 上弹性深度学习训练利器 -- Elastic Training Operator

发布于: 2021 年 02 月 19 日


作者 | 徐晓舟(萧元)

来源|阿里巴巴云原生公众号


背景


由于云计算在资源成本和弹性扩容方面的天然优势,越来越多客户愿意在云上构建 AI 系统,而以容器、Kubernetes 为代表的云原生技术,已经成为释放云价值的最短路径, 在云上基于 Kubernetes 构建 AI 平台已经成为趋势。


当面临较复杂的模型训练或者数据量大时,单机的计算能力往往无法满足算力要求。通过使用阿里的 AiACC 或者社区的 horovod 等分布式训练框架,仅需修改几行代码,就能将一个单机的训练任务扩展为支持分布式的训练任务。在 Kubernetes 上常见的是 kubeflow 社区的 tf-operator 支持 Tensorflow PS 模式,或者 mpi-operator 支持 horovod 的 mpi allreduce 模式。


现状


Kubernetes 和云计算提供敏捷性和伸缩性,我们可以通过 cluster-AutoScaler 等组件为训练任务设置弹性策略,利用 Kubernetes 的弹性能力,按需创建,减少 GPU 设备空转。


但这种伸缩模式面对训练这种离线任务还是略有不足:


  • 不支持容错,当部分 Worker 由于设备原因失败,整个任务需要停止重来。

  • 训练任务一般时间较长,占用算力大,任务缺少弹性能力。当资源不足时,除非任务终止,无法按需为其他业务腾出资源。

  • 训练任务时间较长,不支持 worker 动态配置, 无法安全地使用抢占实例,发挥云上最大性价比


如何给训练任务赋予弹性能力,是提高性价比的关键路径。近期 horovod 等分布式框架逐渐支持了 Elastic Training,即弹性训练能力。也就是允许一个训练任务在执行的过程中动态的扩容或者缩容训练 worker, 从不会引起训练任务的中断。需要在代码中做少量修改适配,可参考:https://horovod.readthedocs.io/en/stable/elastic_include.html


对 Elastic training 的实现原理感兴趣可以看这篇 Elastic Horovod 设计文档, 本文不详细介绍。



在 mpi-operator 中,参与训练的 Worker 都是作为静态资源设计和维护,支持弹性训练模式后,给任务增加了灵活性,同时也给运维层带来了挑战,例如:


  • 必须通过 horovod 提供的 horovordrun 作为入口,horovod 中 launcher 通过 ssh 登陆 worker,需要打通 launcher 和 worker 之间的登陆隧道。


  • 负责计算弹性的 Elastic Driver 模块通过指定 discoverhost 脚本获取最新 worker 拓扑信息,从而拉起或停止 worker 实例。当 worker 变化时,首先要更新 discoverhost 脚本的返回值。


  • 在抢占或价格计算等场景中,有时需要指定 worker 缩容,K8s 原生的编排元语 deployment,statefulset 无法满足指定缩容的场景。


解决方法


针对以上问题,我们设计开发了 et-operator,提供 TrainingJob CRD 描述训练任务, ScaleOut 和 ScaleIn  CRD 描述扩容和缩容操作, 通过它们的组合,使我们的训练任务更具有弹性。将这个方案开源,欢迎大家提需求、交流、吐槽。


开源方案地址:https://github.com/AliyunContainerService/et-operator


设计


TrainingJob Controller 主要有以下功能:


  • 维护 TrainingJob 的创建/删除生命周期,以及子资源管理。

  • 执行扩缩容操作。

  • 容错,当 worker 被驱逐,创建新的 worker 加入到训练中。


1. 资源创建


TrainingJob 子资源创建顺序如下:


  • 创建打通 ssh 所需的密钥对, 创建 secret。

  • 创建 workers,包含 service 和 pod,挂载 secret 公钥。

  • 创建 configmap, 包含 discover_host 脚本 , hostfile 文件。

  • 创建 launcher,挂载 configmap。由于 hostfile 后续会随着拓扑关系修改,所以 hostfile 单独通过 initcontainer 从 configmap 拷贝到单独目录。


TrainingJob 相关资源:



TrainingJob CR 的配置分为 Lanucher 和 Worker。在 Launcher 中指定任务的镜像和启动执行, 默认 et-operator 会根据 worker 分配情况,生成一个 hostfile 文件和 discoverhost 脚本,discoverhost 脚本挂载到 Launcher 的 /etc/edl/discover_hosts.sh 文件, 在入口脚本的 horovodrun 执行中通过 --host-discovery-script 参数指定。在 Worker 设置中指定 worker 的镜像和 GPU 占用 ,并可以通过 maxReplicas / minReplicas 指定 workers 的副本数允许范围。


apiVersion: kai.alibabacloud.com/v1alpha1kind: TrainingJobmetadata:  name: elastic-training  namespace: defaultspec:  cleanPodPolicy: Running  etReplicaSpecs:    launcher:      replicas: 1      template:        spec:          containers:          - command:            - sh            - -c            - horovodrun -np 2 --min-np 1 --max-np 9 --host-discovery-script              /etc/edl/discover_hosts.sh python /examples/elastic/tensorflow2_mnist_elastic.py            image: registry.cn-huhehaote.aliyuncs.com/lumo/horovod:master-tf2.1.0-torch1.4.0-mxnet-py3.6-gpu            imagePullPolicy: Always            name: mnist-elastic    worker:      maxReplicas: 9      minReplicas: 1      replicas: 2      template:        spec:          containers:          - image: registry.cn-huhehaote.aliyuncs.com/lumo/horovod:master-tf2.1.0-torch1.4.0-mxnet-py3.6-gpu            imagePullPolicy: Always            name: mnist-elastic            resources:              limits:                nvidia.com/gpu: "1"              requests:                nvidia.com/gpu: "1"status:  currentWorkers:  - elastic-training-worker-0  - elastic-training-worker-1  - elastic-training-worker-2  - elastic-training-worker-3  phase: Succeeded  replicaStatuses:    Launcher:      active: 1      succeeded: 1    Worker:      active: 4
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2. Worker 扩容 / 缩容


除了 TrainingJob 外,et-operator 同时支持 ScaleOut 和 ScaleIn 两种 CRD,下发训练任务扩容和缩容操作。


当下发一个 ScaleOut CR,ScaleOutController 触发 Reconcile, 这里工作很简单,根据 ScaleOut CR 中的 Selector 字段,找到 Scaler 对应的 TrainingJob,设置到 CR 的 OwnerReferences 上。


以一个 ScaleOut 操作举例:


- apiVersion: kai.alibabacloud.com/v1alpha1  kind: ScaleOut  metadata:    creationTimestamp: "2020-11-04T13:54:26Z    name: scaleout-ptfnk    namespace: default    ownerReferences:    - apiVersion: kai.alibabacloud.com/v1alpha1      blockOwnerDeletion: true      controller: true      kind: TrainingJob      name: elastic-training // 指向扩容对象TrainingJob      uid: 075b9c4a-22f9-40ce-83c7-656b329a2b9e  spec:  selector:    name: elastic-training  toAdd:    count: 2
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TrainingJobController 中监听到属于 TrainingJob  的 ScaleOut CR 有更新, 触发 TrainingJob 的 Reconcile,遍历过滤 TrainingJob 下 OwnerReference 指向的 ScaleIn 和 ScaleOut, 根据创建时间和状态时间决定执行的扩容或者缩容。


apiVersion: kai.alibabacloud.com/v1alpha1kind: TrainingJobmetadata:  name: elastic-training  namespace: defaultspec:   // ...... Launcher and Worker specstatus:  currentScaler: ScaleIn:default/scaleout-ptfnk  phase: Scaling  currentWorkers:  - elastic-training-worker-0  - elastic-training-worker-1
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ScaleOut 任务 CR:



ScaleIn 任务 CR:



详细工作过程:



运行


1. 安装 ET-Operator


mkdir -p $(go env GOPATH)/src/github.com/aliyunContainerServicecd $(go env GOPATH)/src/github.com/aliyunContainerServicegit clone https://http://github.com/aliyunContainerService/et-operatorcd et-operatorkubectl create -f deploy/all_in_one.yaml 
复制代码


检测 crd 的安装:


# kubectl get crdNAME                                    CREATED ATscaleins.kai.alibabacloud.com           2020-11-11T11:16:13Zscaleouts.kai.alibabacloud.com          2020-11-11T11:16:13Ztrainingjobs.kai.alibabacloud.com       2020-11-11T11:16:13Z
复制代码


检测 controller 的运行状态,默认安装在 kube-ai 中:


# kubectl -n kube-ai get poNAME                                         READY   STATUS              RESTARTS   AGEet-operator-controller-manager-7877968489-c5kv4   0/2     ContainerCreating   0          5s
复制代码


2. 运行 TrainingJob


运行事先已准备好的示例:


kubectl apply -f examples/training_job.yaml
复制代码


检测运行状态:


# kubectl get trainingjobNAME                          PHASE     AGEelastic-training              Running   77s
# kubectl get poNAME READY STATUS RESTARTS AGEelastic-training-launcher 1/1 Running 0 7selastic-training-worker-0 1/1 Running 0 10selastic-training-worker-1 1/1 Running 0 9s
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3. 缩容训练任务 Worker


执行缩容时,可以通过 ScaleIn CR 中的 spec.toDelete.count  或 spec.toDelete.podNames  字段指定缩容的 worker。


通过 count 配置缩容的数量,则通过 index 计算由高到低缩容 Worker。


apiVersion: kai.alibabacloud.com/v1alpha1kind: ScaleInmetadata:  name: scalein-workersspec:  selector:    name: elastic-training  toDelete:    count: 1
复制代码


如果想要缩容特定的 Worker,可以配置 podNames:


apiVersion: kai.alibabacloud.com/v1alpha1kind: ScaleInmetadata:  name: scalein-workersspec:  selector:    name: elastic-training  toDelete:    podNames:    - elastic-training-worker-1
复制代码


运行一个缩容示例,指定数量缩容 1 个 worker:


kubectl create -f examples/scale_in_count.yaml
复制代码


检测缩容执行状态和训练任务:


# kubectl get scaleinNAME                                     PHASE            AGEscalein-sample-t8jxd                     ScaleSucceeded   11s
# kubectl get poNAME READY STATUS RESTARTS AGEelastic-training-launcher 1/1 Running 0 47selastic-training-worker-0 1/1 Running 0 50s
复制代码


4. 扩容训练任务


在 ScaleOut CR 中,通过 spec.toAdd.count 字段指定扩容的 worker 数:


apiVersion: kai.alibabacloud.com/v1alpha1  kind: ScaleOut  metadata:    name: elastic-training-scaleout-9dtmw    namespace: default  spec:    selector:      name: elastic-training    timeout: 300    toAdd:      count: 2
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运行示例:


kubectl create -f examples/scale_out.yaml
复制代码


检测缩容执行状态和训练任务:


kubectl get scaleoutNAME                                     PHASE            AGEelastic-training-scaleout-9dtmw          ScaleSucceeded   30skubectl get poNAME                                      READY   STATUS             RESTARTS   AGEelastic-training-launcher                 1/1     Running            0          2m5selastic-training-worker-0                 1/1     Running            0          2m8selastic-training-worker-1                 1/1     Running            0          40selastic-training-worker-2                 1/1     Running            0          40s
复制代码


总结


ET-Operator 提供一组训练和扩缩容 CRD 和 Controller, 让我们在 Kubernetes 上方便地运行弹性分布式训练,支持下发分布式训练任务,并通过和分布式框架的集成联动,在训练任务运行过程中动态地扩容和缩容参与运算的 Workers。使我们的训练任务具有弹性能力,结合抢占实例,能够更好的利用云上的资源弹性和性价比优势。


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