「毅硕|生信教程」 micromamba：mamba 的 C++ 实现，超越 conda
1 Micromamba 简介
大家是否有这样的经历，使用 conda/anaconda 进行环境配置的是否速度非常慢，进度经常卡在“Collecting package metadata”上。甚至有时候需要安装的软件比较多，或者需要用到 conda-forge 这个最大的 channel，conda 能一直卡在 collecting 步骤上直到 http 连接超时也没能处理完毕。直到有天小编发现了 mamba 这个工具，进而发现了 micromamba（micromamba 是 mamba 包管理器的小型版本，采用 C++实现，具有 mamba 的核心功能，且体积更小，可以脱离 conda 独立运行，更易于部署），从此再也没有因为生信软件的安装配置而烦恼抓狂过。闲话少说，开始我们的教程。
2 Micromamba 教程
2.1 安装与配置
小编比较推荐国内用户从 miniconda 的安装起手，这里使用的是 TUNA 镜像站的链接，https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py311_24.4.0-0-Linux-x86_64.sh。下载完毕后，执行命令
通常没有特殊需求的情况下，一路“enter，yes”把 miniconda 安装到 ${HOME}/miniconda3 即可。一般安装完毕后会询问是否直接执行 conda init 命令，回车即可。这样以后登录的时候就自动加载进入 base 环境，可以便捷使用 conda 的各种功能。如果没有继续回车执行，或者执行失败，则可以
成功以后，~/.bashrc 文件（其他 sh 则是其各自的 rc 文件路径）会有如下类似的内容
接着我们配置 condarc 文件，condarc 文件路径可以是 ~/.condarc ，也可以是 conda base 环境下的 $CONDA_PREFIX/.condarc。一般情况下使用 ~/.condarc 即可。创建 condarc 文件
然后我们就可以在 conda base 环境下安装 micromamba
安装完毕后，执行
至此，miniconda 和 micromamba 的配置就完成了。（小编的这种做法是为了能利用 conda 的 api 去调用 micromamba 配置的环境，所以就把 MAMBA_ROOT_PREFIX 变量设置成和 conda base 的 $CONDA_PREFIX 一样）
2.2 测试
开始测试
用 micromamba 进行搜索
运行神速，很快就得到结果了
然后我们可以创建环境并安装
非常快就创建好了，此时我们用 conda activate 切换环境。
2.3 结尾
本文也只是简单的入门，micromamba 的配置方法还有很多，感兴趣的同学可以访问https://mamba.readthedocs.io/en/latest/user_guide/micromamba.html 获取更多信息。
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